Vreemd genoeg bemoeit Nintendo zich met deze update niet met de Homebrew Channel, een gehackt kanaal waarmee hetzelfde resultaat geboekt kan worden als met de Twilight Loader. Vermoedelijk is de Homebrew Channel pas verschenen nadat Wii Menu 3.3 zich al in test bevond. Nintendo onderneemt vooralsnog ook geen stappen tegen gekraakte Virtual Channel-games op de Wii.

Wel maakt Wii Menu 3.3 een einde aan het laden van gepatchte schijfjes. Met de zogenaamde Trucha Signer konden eigen gebrouwen schijfjes voorzien worden van een geldige Nintendo-code. Dit is nu niet meer mogelijk, waardoor bijvoorbeeld de Datel Freeloader niet meer werkt.

Wie zijn console nog niet geupdate heeft, kan hiervan afzien -- in ieder geval tot er spellen verschijnen die Wii Menu 3.3 vereisen. De homebrew-scene is inmiddels hard op zoek naar een nieuwe oplossing.